Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHPT1Q9NRX4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms