Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms