Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FANCFQ9NPI8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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