Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FZD3Q9NPG1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FZD3Q9NPG1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms