Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJC4Q9NNZ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms