Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf42Q9H799 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms