Protein–RNA interactions for Protein: Q9H467

CUEDC2, CUE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUEDC2Q9H467 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUEDC2Q9H467 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms