Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED28Q9H204 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED28Q9H204 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms