Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC113Q9H0I3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC113Q9H0I3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms