Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP44Q9H0E7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP44Q9H0E7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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