Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LNPKQ9C0E8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LNPKQ9C0E8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms