Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT23Q9C075 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT23Q9C075 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms