Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PCGF6Q9BYE7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms