Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPCDR1Q9BY65 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPCDR1Q9BY65 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms