Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HIRIP3Q9BW71 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HIRIP3Q9BW71 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms