Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPOQ9BU64 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms