Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PAGR1Q9BTK6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms