Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms