Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP1Q99575 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP1Q99575 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POP1Q99575 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP1Q99575 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP1Q99575 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP1Q99575 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP1Q99575 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP1Q99575 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP1Q99575 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POP1Q99575 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POP1Q99575 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms