Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms