Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD1Q99460 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms