Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALS2CR12Q96Q35 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms