Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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