Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms