Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms