Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCLT1Q96NL6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCLT1Q96NL6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms