Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG8Q96MW5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms