Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms