Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMTD1Q96MG8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms