Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms