Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNBD2Q96M20 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms