Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EP400Q96L91 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms