Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD4Q96KN9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms