Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM2Q96JY6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms