Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms