Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAMP1Q96JM3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAMP1Q96JM3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms