Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED3Q96IU2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms