Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms