Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms