Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms