Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM44Q96DX7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms