Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSUN4Q96CB9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSUN4Q96CB9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms