Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35C1Q96A29 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms