Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX21Q969T3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms