Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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