Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIRE2Q8WWL2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms