Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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