Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELBQ8NG08 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELBQ8NG08 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms