Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM58Q8NG06 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM58Q8NG06 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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