Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNERQ8NFT8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNERQ8NFT8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms